已知某自花传粉植物的红叶与绿叶，紫花与白花，高茎与矮茎三对相对性状，各由一对等位基因控制，但不知道每对性状的显隐性关系以及控制它们基因的位置关系。现选用红叶紫花矮茎的纯合品种做母本，绿叶白花高茎的纯合品种做父本，进行杂交实验，结果F1表现为红叶紫花高茎。请回答下列问题：
（1）、欲探究这三对基因的位置关系，将F1自交，收获并播种F1植株所结的全部种子后，长出的全部植株（填“是”或“不是”）都表现为红叶紫花高茎，为什么？。
（2）、若F1自交实验结果是红叶紫花高茎植株所占比例为，则这三对等位基因分别位于三对同源染色体上，判断的理由是。
（3）、题中两个纯合亲本杂交后代F1群体中出现一株红叶紫花矮茎的植株甲，为了弄清植株甲出现矮茎的原因是基因突变造成的，还是生长发育过程中环境中个别偶然因素影响造成的？请设计一个实验进行探究。（要求：写出实验方案、预期实验结果、得出实验结论）。
